Животный мир (фауна) весьма беден. Встречаются лишь мелкие млекопитающие: гиены, шакалы, лисы, ихневмоны, или «фараоновы мыши», - небольшие хищные зверьки, поедающие грызунов (их часто содержат в домах вместо кошек). Много пресмыкающихся.
Пернатыми наиболее богата северная часть дельты. Сюда из Европы прилетают на зимовку аисты, белые, пурпурные и серые цапли, дикие гуси и др.
В долине повсеместно распространены перепела. Из хищных птиц часто встречаются соколы и сарычи, иногда крупные грифы и стервятники.
В омывающих территорию Египта Красном и Средиземном морях много рыбы.
Красноморское побережье обладает богатейшими в видовом отношении коралловыми рифами. Здесь распространены: дельфины, дюгони, акулы, морские черепахи.
Из рыб в Средиземном море преобладают мерланы, морские петухи, кефали, сардины и камбалы.
Из моллюсков – осьминоги, кальмары, сепии.
В водах Нила - нильский окунь, африканский сом, зубатый карп, тигровая рыба и т.д.