В 1655 году, после притеснений португальской колональной администрации Индии, часть несториан малабарцев установила отношения с яковитами (Сирийская православная церковь), приняв от них монофизитскую доктрину, которая восходит к учению Евтихия.
Евтихий учил, что в начале раздельно существовали две природы Христа – Бог и Человек, однако при соединении их при боговоплощении стала существовать лишь одна. В дальнейшем некоторые Монофизиты и вовсе отрицали наличие какого-либо человеческого элемента в природе Христа, или что человеческая природа была полностью поглощена божественной.
В 451 году Халкидонский вселенский собор принял диофизитскую доктрину и осудил монофизитство как ересь.
В настоящее время монофизитской доктрины придерживаются – Коптская православная церковь, Армянская апостольская церковь, Эфиопская и Нубийские православные церкви, Сирийская православная (яковитская) церковь, включая Маланкарскую и Малабарскую сирийскую церковь Востока Мар-Тома.
Культ в монофизитских церквах заметно варьирует, при этом очень близок православному. В Малабарской сирийской церкви Востока принята западносирийская литургия Св. Якова. Богослужение совершается на сирийском языке, а также на языке малаялам. В сирийских храмах очень мало икон (иногда просто отсутствуют), хотя они и почитают иконы и святых.
Религиозным центром является город Каттайян (Керала).
В настоящее время сиро-малабарцы разделились на две группы: одна из них признаёт верховную церковную власть патриарха Сирийской православной церкви, другие являются сторонниками независимого митрополита (каталикоса).
Общая численность монофизитов малабарцев – 1,7 млн. чел. (по национальной принадлежности – это в основном малаяли).