Города
Наибольшее количество крупных городов (также как и всего населения) сконцентрировано на Малаккском полуострове.
Крупнейший город Малайзии – бывшая столица страны Куала-Лумпур (1,479,388 человек в 2004 г.).
На юге п-ова Малакка находится другой крупный город страны Джохор-Бару (административный центр штата Джохор и крупный промышленный центр) - более 600 тыс. населения.
В самом центре долины р. Кинта расположен город Ипох - свыше 500 тыс. человек.
Другие крупные города Малакки - города Келанг (административный центр шт. Селангор и важный портовый город) и Петалинг, построенный в 1950-х годах юго-западнее столицы в качестве ее спутника.
Города Келанг, Петалинг и Шах-Алам входят в состав метрополитенского ареала Куала-Лумпура.
В последние годы на северо-востоке Полуостровной Малайзии быстро выросли два города, вышедшие соответственно на шестое и седьмое места по численности населения: Кота-Бару (административный центр шт. Келантан) и Куала-Тренгану (административный центр штата Тренгану).
Портовый город Джорджтаун на о.Пинанг, имеющий глубоководные причалы, стал стремительно развиваться с середины 1990-х годов. С 1985 он связан мостом с п-вом Малакка.
Калимантан
Крупнейшие города малайзийской части Калимантана – Кота-Кинабалу, административный центр штата Сабах, и Кучинг, административный центр штата Саравак.